Уважаемый К.О., Вы спрашиваете, сколько именно прудов мы, москвичи, насчитываем в месте с названием "Патриаршие пруды"?!
Да, Вы имели счастье видеть только один пруд квадратной формы (спасибо благоустройству 1950-х гг.). Я с радостью объясню Ваше недоумение, возникшее в связи с несоответствием этого факта употреблению в названии "Патриаршие пруды" формы множественного числа.
Все дело в том, что XVII веке в усадьбе патриарха на Козьем болоте существовало три пруда - два на р. Бубне и один на ее притоке (эта речка принадлежат бассейну р. Пресни). Только один из прудов - исток р. Бубны - дошел до настоящего времени, Вы его и видели, а два других вместе с речками были засыпаны в первой половине XIX в., и на их месте сейчас находится Трехпрудный переулок. Поэтому и "пруды".
Очень приятно, что Вас так заинтересовала история водоемов нашего города. Пишите еще!